生物信息学预测的果蝇黑腹长寿基因和通路
人类一直在寻求长寿。 已经表明，基因改变会影响寿命。 果蝇体内有大量的抗长寿和促长寿基因。 很难在如此庞大的基因阵列中筛选功能重要的基因。 本研究旨在调查影响果蝇寿命的关键基因和途径。 在这项研究中，使用了人类衰老基因组资源数据库 (HAGR)，其中包含 168 个与黑腹果蝇长寿相关的基因。 为了确定关键基因和通路，我们将网络聚类分析与网络拓扑分析和通路分析相结合。 定量实时 PCR (qRTPCR) 用于确认代表性通路中基因的表达，并从基因-基因网络预测基因。 我们的结果表明，有六种途径可能与长寿有关。 这些包括长寿调节通路、过氧化物酶体通路、FOXO 信号通路和糖尿病并发症中的 AGE RAGE 信号通路。 结果还显示，Cat、Ry S6k Sod Tor Tsc1、Tsc1、Tsc1、Jra、Kay 和 Rheb 等代表性通路的 6 个基因以及预测基因 Jra 和 Kay 的表达随着黑腹果蝇菌株的老化而发生显着变化 w1118. 我们的结果表明，六个途径、六个关键基因和三个相互关联的基因可能在调节黑腹果蝇 w1118 菌株的寿命中发挥关键作用。 这些结果不仅将提供对长寿机制的新见解，还将为基于网络的长寿研究方法提供新思路。
来源和详细信息：
https://link.springer.com/article/10.1007/s00438-019-01589-1
