细胞衰老的多维系统生物学分析
细胞衰老是衰老的标志，它与癌症等年龄相关疾病有关。 衰老细胞积聚在衰老生物体的组织中，可引起慢性炎症。 细胞衰老与许多基因有关，但对细胞衰老途径的完整理解仍然难以捉摸。 为此，我们创建了 CellAge (http://genomics.senescence.info/cells)，这是一个包含 279 个与细胞衰老相关的人类基因的手动精选数据库，并进行了各种综合和功能分析。 我们发现促进细胞衰老的基因在老年人的组织中过度表达，并且在抗衰老和肿瘤抑制基因的数据库中也过度表达。 抑制细胞衰老的基因与延长基因和癌基因重叠。 此外，进化分析揭示了哺乳动物衰老相关基因的强烈保守性，但无脊椎动物则不然。 我们还使用 CellAge 基因作为种子节点构建了蛋白质-蛋白质相互作用和共表达网络。 网络的簇在细胞周期和免疫过程中更加丰富。 网络拓扑参数还揭示了新的潜在衰老相关调节因子。 然后，我们使用 siRNA 观察到 26 名候选者中有 19 名测试了衰老的诱导标记。 我们的工作为研究人员提供了一种研究细胞死亡的新工具，我们的系统生物学分析揭示了新基因和关于细胞衰老的新见解。
http://genomics.senescence.info/cells/
来源和详细信息：
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/743781v1
